国科大的本科生招生规模较小，希望学生毕业后继续深造。国科大将鼓励学生进行“本-硕”或“本-硕-博”连读，攻读硕士或博士学位，也支持和帮助学生到国内外更高水平的大学或科研机构继续学习。由于国科大每年需招收 7800余名的硕士生和硕-博连读生，预计学业合格的大部分本科生都会被提前招收为研究生。