| 专业名称 | 学制 | 学费（元/学年） | 收费标准批文 |
| 中医学 | 5 | 6200 | 闽中〔2004〕95号 |
| 针灸推拿学 | 5 | 6200 | 闽中〔2004〕95号 |
| 中药学 | 4 | 5800 | 闽中〔2004〕95号 |
| 药学 | 4 | 6200 | 闽中〔2004〕95号 |
| 制药工程 | 4 | 6200 | 闽中〔2006〕29号 |
| 市场营销（药品营销方向） | 4 | 5000 | 闽中〔2006〕29号 |
| 中西医临床医学 | 5 | 6200 | 闽中〔2004〕95号 |
| 临床医学 | 5 | 6200 | 闽中〔2004〕95号 |
| 康复治疗学（物理治疗方向） | 4 | 6200 | 闽中〔2011〕59号 |
| 康复治疗学（作业治疗方向） | 4 | 6200 | 闽中〔2011〕59号 |
| 公共事业管理（卫生管理方向） | 4 | 5000 | 闽中〔2004〕95号 |
| 公共事业管理（医事法律方向） | 4 | 5000 | 闽中〔2004〕95号 |
| 公共事业管理（健康保险方向） | 4 | 5000 | 闽中〔2010〕73号 |
| 信息管理与信息系统（医学信息方向） | 4 | 5000 | 闽中〔2011〕59号 |
| 护理学 | 4 | 5800 | 闽中〔2004〕95号 |
| 医学影像技术(闽台合作项目) | 4 | 18000 | 闽价费〔2012〕410号 |
| 食品科学与工程(闽台合作项目) | 4 | 15000 | 闽价费〔2012〕410号 |
以上学费标准已经福建省物价局批准。其中，中医学专业（“5+3”一体化）学费在本科生阶段按每学年6200元收费（收费标准批文：闽中〔2004〕95号），研究生阶段按当年上级部门批准的标准执行；闽台合作项目专业学生第三年到台湾合作高校学习，学费标准按台湾合作高校当年学费标准缴交。
退费办法：根据福建省物价局、福建省财政厅、福建省教育厅（闽价〔2005〕费435号）通知中的相关规定执行。